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毫無(wú)疑問(wèn)，未來(lái)的癌癥治療將會(huì)根據(jù)患者特異性的生物標(biāo)志物變得越來(lái)越個(gè)性化。在實(shí)現(xiàn)癌癥個(gè)性化治療的道路上，下一代測(cè)序（NGS）技術(shù)發(fā)揮著不可取代的作用。在過(guò)去的幾年里，NGS變得更加精確，它幫助研究人員和病理學(xué)家實(shí)現(xiàn)了從單基因檢測(cè)到多基因檢測(cè)的完美轉(zhuǎn)換。
NGS通過(guò)廣泛的基因篩查，預(yù)測(cè)癌癥的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)，幫助醫(yī)生確定癌癥不同亞型的特異性療法。從另一方面來(lái)說(shuō)，NGS通過(guò)解碼不同癌癥的基因變異信息，為醫(yī)生更好的理解癌癥的發(fā)病機(jī)制提供了很大的幫助。在了解患者遺傳學(xué)信息的基礎(chǔ)上，他們可以從多種癌癥療法中選擇對(duì)病人最佳的治療方案。
德克薩斯大學(xué)MD安德森癌癥中心分子診斷部門(mén)主任 Rajyalakshmi Luthra 博士說(shuō)：“如今，大多數(shù)的分子診斷實(shí)驗(yàn)室都在通過(guò)測(cè)序技術(shù)尋找與各種疾病相關(guān)的基因或其它標(biāo)志物。我們知道每個(gè)癌癥類(lèi)型都可能有多個(gè)分子標(biāo)記，為了更好的進(jìn)行靶向治療，我們不得不尋找更多的靶標(biāo)?！?/span>
NGS在癌癥治療中的現(xiàn)狀
雖然NGS技術(shù)在近些年取得了巨大的進(jìn)步，但是它依然是一個(gè)相對(duì)昂貴的技術(shù)。盡管目前測(cè)幾百個(gè)基因的成本可能只相當(dāng)于五年前測(cè)單個(gè)基因的成本，但是每次檢測(cè)的平均成本依然在2500-5000美元之間。出于這樣的原因，NGS的發(fā)展大部分依然局限在大型的學(xué)術(shù)醫(yī)療中心和診斷公司的實(shí)驗(yàn)室中。
臨床診斷公司 BioReference Laboratories 的研發(fā)主任 Robert Daber 表示，NGS的應(yīng)用仍處于初級(jí)階段，要想在使NGS使用更加廣泛，我們必須做到以下兩點(diǎn)：第一，它需要覆蓋更多與臨床相關(guān)的可控突變；第二，它需要使成本更加“親民”，且具有實(shí)際的檢測(cè)效果。
Luthra博士說(shuō)：“三年前MD安德森癌癥中心開(kāi)始使用NGS技術(shù)，我們的目標(biāo)是從分子水平對(duì)腫瘤進(jìn)行分析，為臨床醫(yī)生治療病人提供特異性標(biāo)志物。然而，我們得到的腫瘤樣本的數(shù)量其實(shí)非常有限，因此，我們不能像以前做試驗(yàn)一樣一次只檢測(cè)一個(gè)標(biāo)志物?！?/span>
“其實(shí)，除了與臨床相關(guān)的標(biāo)志物，那些目前被鑒定為與臨床無(wú)關(guān)的突變也一樣重要?！盌aber博士說(shuō)，“可能有些突變只在極少數(shù)腫瘤（1%或1.5%）中被發(fā)現(xiàn)，但問(wèn)題是，這些獨(dú)特的突變究竟會(huì)影響癌癥的發(fā)展，還是與不含這種突變的患者相差無(wú)幾。目前，我們也沒(méi)有明確的答案?！?/span>
NGS的局限性
因?yàn)镹GS仍是一個(gè)非常新鮮的技術(shù)，儀器公司一直在不斷尋找改善NGS檢測(cè)方法以及他們提供的數(shù)據(jù)和信息工具的途徑。這也是很多機(jī)構(gòu)不想在他們的實(shí)驗(yàn)室開(kāi)展NGS的原因，不斷更新的成本實(shí)在太大了。
Luthra博士說(shuō)：“廠(chǎng)商總是在不斷努力改善他們的硬件和軟件，當(dāng)然，這也是合情合理的。任何一個(gè)新的有前途的技術(shù)都需要不斷的進(jìn)步。然而，在臨床實(shí)驗(yàn)室中，你不可能總是回頭驗(yàn)證之前的結(jié)果是否正確。在一些小型或中等規(guī)模的實(shí)驗(yàn)室，他們也不可能收集到足夠的樣本來(lái)重復(fù)驗(yàn)證?！?/span>
另一個(gè)在未來(lái)需要解決的限制因素是，腫瘤學(xué)家的遺傳學(xué)素養(yǎng)應(yīng)該進(jìn)一步提高。美國(guó)阿拉巴馬大學(xué)基因組科學(xué)Heflin中心的主任 Bruce Korf 博士說(shuō)：“在基因組時(shí)代到來(lái)之前，臨床醫(yī)生需要進(jìn)行大量的遺傳學(xué)信息的學(xué)習(xí)，只有真正了解了基因組在疾病發(fā)生中扮演的角色，才能在實(shí)踐中利用好它們?！?/span>
NGS在癌癥治療中的展望
當(dāng)然，依據(jù)NGS技術(shù)完成臨床決策還為時(shí)尚早，但是學(xué)術(shù)醫(yī)療中心和診斷公司每天積累的數(shù)據(jù)是進(jìn)一步解開(kāi)疾病秘密的關(guān)鍵。Daber博士說(shuō)：“NGS讓我們了解了如此多的基因，接下來(lái)我們真正需要做的是整理這些重要標(biāo)志物的信息（包括檢測(cè)方法、致病機(jī)理等），IT技術(shù)也可以為我們所用?！?/span>
Luthra博士補(bǔ)充說(shuō)：“隨著越來(lái)越多的標(biāo)志物被鑒定出來(lái)，醫(yī)生可以判斷是否需要對(duì)患者進(jìn)行多基因檢測(cè)。商家可以先提供具有針對(duì)性的檢測(cè)服務(wù)供一些小型的醫(yī)院選擇。如果醫(yī)院需要更多的病人基因組信息，他們?cè)龠x擇更全面的檢測(cè)項(xiàng)目。這樣一來(lái)，NGS技術(shù)會(huì)進(jìn)入更多的醫(yī)院。”
盡管實(shí)現(xiàn)這一愿望可能需要好多年，但是Luthra博士依然相信，隨著大數(shù)據(jù)的發(fā)展和進(jìn)步，NGS技術(shù)必將為癌癥個(gè)性化治療提供更多的遺傳信息依據(jù)，也會(huì)成為醫(yī)院疾病診治的有效媒介。